Набор реагентов для качественного определения РНК коронавируса SARS-CoV-2 методом ОТ-ПЦР с детекцией в режиме "реального времени" (Amplitech SARS-CoV-2 (D)) по ТУ 21.20.23-011-19926214-2021 — инструкция и характеристики
Открытые закупки, где изделие проходит ТЗ
Сейчас открытых закупок, где изделие полностью проходит ТЗ, нет; список обновляется каждый день.
Построчная сверка ТЗ с характеристиками этого изделия и все закупки под ваши товары — в кабинете, 7 дней бесплатно.
Попробовать бесплатно
Текст инструкции: технические характеристики
--- стр. 2 ---
0
АМПЛИТЕК
АтрМ1ес11 8АР8-Со\/-2 (О)
Набор реагентов для качественного определения РНК
О коронавируса 5АР8-Со\/-2 методом ОТ-ПЦР с детекцией
в режиме «реального времени» {АтрН1есЬ 8АР8-Со\/-2 (О))
ИНСТРУКЦИЯ по ПРИМЕНЕНИЮ
О
1У0 ВЕР| Р006-0 ^ ^ 9 6
--- стр. 3 ---
ВВЕДЕНИЕ..................................................................................................................... 3
1 НАЗНАЧЕНИЕ........................................................................................................................4
1.1 Область применения.................................................................................................. 4
2 СОСТАВ................................................................................................................................ 4
3 ПРИНЦИП МЕТОДА.............................................................................................................5
3.1 Характеристика положительного контроля ПК 5С2................................................5
4 НЕОБХОДИМОЕ ОБОРУДОВАНИЕ И МАТЕРИАЛЫ....................................................5
5 ПРЕДУПРЕЖДЕНИЯ И МЕРЫ ПРЕДОСТОРОЖНОСТИ .............................................6
5.1 Предупреждения................................................................................................................6
5.2 Меры предосторожности ................................................................ 6
6 ИССЛЕДУЕМЫЙ МАТЕРИАЛ..............................................................................................7
7 ПРОВЕДЕНИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.....................................................................................8
7.1 Исследование методом «прямой» ОТ-ПЦР (без экстракции РНК) мазков из
носоглотки и/или ротоглотки, взятых в транспортную среду «ТС (О)».........................8
7.2 Исследование образцов биологического материала, включая экстракцию
РНК ............................................................................................................................................9
8 УЧЁТ И ИНТЕРПРЕТАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ .................................................................11
9 ВОЗМОЖНЫЕ ОШИБКИ.................................................................................... 12
10 КОНТРОЛЬ КАЧЕСТВА..................................................................................................12
10.1 Контроли, используемые в процессе исследования ........................................12
10.2 Мониторинг лаборатории на наличие контаминации .......................................13
10.3 Внутренний контроль качества лабораторных исследований........................13
11 ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ НАБОРА................................................13
11.1 Предел обнаружения...............................................................................................13
11.2 Аналитическая специфичность ..............................................................................13
11.3 Прецизионность измерений...................................................................................15
11.4 Диагностические характеристики..........................................................................15
12 УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ, ТРАНСПОРТИРОВАНИЯ И ЭКСПЛУАТАЦИИ НАБОРА
.............................................................................................................................................15
12.1 Срок годности.............................................................................................................15
12.2 Хранение....................................................................................................................15
12.3 Транспортирование.................................................................................................15
12.4 Эксплуатация............................................................................................................16
13 ПЕРЕЧЕНЬ СОКРАЩЕНИЙ...........................................................................................16
14 БИБЛИОГРАФИЯ.............................................................................................................16
15 ПЕРЕЧЕНЬ ПРИМЕНЯЕМЫХ НАЦИОНАЛЬНЫХ СТАНДАРТОВ .........................16
16 ГАРАНТИИ ПРОИЗВОДИТЕЛЯ....................................................................................17
17 ТЕХНИЧЕСКАЯ ПОДДЕРЖКА ......................................................................................17
18 СИМВОЛЫ, ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ В ДОКУМЕНТАЦИИ ПРОИЗВОДИТЕЛЯ ...........17
СОДЕРЖАНИЕ
Атр111есИ 8АР8-СоУ-2 (О) Инструкция в.14,11.22
--- стр. 4 ---
1. Настоящая инструкция по применению версии 14.11.22 распространяется на
медицинское изделие «Набор реагентов для качественного определения РНК
коронавируса 5АР5-Со\/-2 методом ОТ-ПЦР с детекцией в режиме «реального
времени» (Атр1КесЬ 5АР5-Со\/-2 (О))», по ТУ 21.20.23-011-19926214-2021 (далее -
набор).
Краткое наименование набора: АтрМ1ес1п 8АК8-Со\/-2 (О).
Набор следует применять в соответствии с действующей версией инструкции по
применению. Для удобства работы в лаборатории допускается использовать
действующую версию краткого руководства по применению набора.
2. Коронавирус 8АР8-Со\/-2 представляет собой оболочечный одноцепочечный
РНК-содержащий вирус из семейства Согопау1пс1ае, рода Ве1асогопау1гиз линии
Ве1а-Со\/ В. 8АР8-Со\/-2 впервые выявлен в конце 2019 года, вызывает опасное
инфекционное заболевание — СО\/Ю-19, отнесён ко II группе патогенности.
8АР8-Со\/-2 включён в перечень заболеваний, представляющих опасность для
окружающих (постановление Правительства РФ от 31 января 2020 г. № 66). Передача
инфекции осуществляется воздушно-капельным, воздушно-пылевым и контактным
путями. Диагноз СО\/Ю-19 устанавливается на основании клинического
обследования, данных эпидемиологического анамнеза и результатов лабораторных
исследований.
ВВЕДЕНИЕ
Атр1КесЬ 8АР8-Со\/-2 (О) Инструкция в. 14.11.22
--- стр. 5 ---
Набор предназначен для качественного определения РНК коронавируса SARS-
CoV-2 в биологическом материале, полученном от лиц с клинической симптоматикой
респираторного заболевания с подозрением на инфекцию COVID-19, а также от лиц,
не имеющих признаков простудных заболеваний, методом ОТ-ПЦР с
гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Материалом для исследования служат образцы РНК, экстрагированной с
применением набора реагентов «РНК-100» (ООО «Амплитек») из следующих видов
биологического материала человека:
• мазки из носоглотки и/или ротоглотки,
• мокрота.
Набор может быть использован для исследования мазков из носоглотки и/или
ротоглотки методом «прямой» ОТ-ПЦР без проведения экстракции РНК при условии,
что мазки собраны в инактивирующую транспортную среду «ТС (D)» (ООО
«Амплитек»).
1.1 Область применения
Набор предназначен для лабораторной диагностики in vitro коронавирусной
инфекции COVID-19 (выявление РНК SARS-CoV-2). Отрицательные результаты
исследования с помощью набора не исключают возможность инфицирования
коронавирусом SARS-CoV-2 и не должны использоваться в качестве единственной
основы для принятия решения о лечении пациента. Отрицательные результаты
исследования должны сочетаться с клиническими наблюдениями, историей болезни
и эпидемиологической информацией.
Набор может применяться в клинико-диагностических лабораториях.
1 НАЗНАЧЕНИЕ
«
2 СОСТАВ
Состав набора^ указан в таблице 1.
Таблица 1
Состав набора
Номинал ь-
Компонент ный Кол-во Внешний вид
объбм, мл
Смесь-1 8С2 (□)
(Б уф ерны й раствор со специф ическим и
прайм ерам и, ф л уоресц ентно-м ечены м и
зондам и и дН ТФ )
0,48 1 пробирка
Прозрачная жидкость от
бесцветного до светло-лилового
цвета
Смесь-2 О
(Б уф ерны й раствор с сульф атом м агния,
теом остабильной Д Н К-пол им еразой. ревертазой)
0,48 1 пробирка Прозрачная бесцветная
жидкость
ВК
(Р аствор, содерж ащ ий генно-инж енерную
КОНСТРУКЦИЮ с синтетическим ф рагм ентом РНЮ
0,96 1 пробирка Прозрачная бесцветная
жидкость
ОК
(Б уф ерны й раствор)
0,8 1 пробирка Прозрачная бесцветная
жидкость
ПКЗС2
(Р аствор, содерж ащ ий генно-инж енерную
конструкцию с ф рагм ентом кД Н К 8 А Я З -С о У -2 )
0,8 1 пробирка Прозрачная бесцветная
жидкость
’ Набор упакован в полиэтиленовый пакет с застёжкой Zip-Lock.
Amplitech SARS-CoV-2 (D) Инструкция в.14.11.22
--- стр. 6 ---
Компонент
Номинал ь>
ный
объбм, мл
Кол-во Внешний вид
Инструкция по применению - 1 шт.
В бумажном виде и электронном
виде по адресу:
ЬКр://\лплгуу. атрШесЬ. ги/гезоигсез/
Краткое руководство - 1 шт. В бумажном виде
Паспорт - 1 шт. В электронном виде^ по адресу:
http://www.amplitech.ru/qualitv/
Набор рассчитан на проведение исследования 96 образцов, включая контроли.
3 ПРИНЦИП МЕТОДА
Исследование с помощью набора проводится методом ОТ-ПЦР с
гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации в режиме
«реального времени». Детекция продуктов ОТ-ПЦР и раздельное выявление РНК
ЗАРЗ-Со\/-2 и внутреннего контроля (ВК) обеспечивается применением в
реакционной смеси для ОТ-ПЦР флуоресцентно-меченых олигонуклеотидов, сигналы
от которых регистрируются по различным каналам флуоресцентной детекции,
указанным в таблице 2.
Таблица 2
Каналы детекции мишеней
Канал детекции сигнала
от флуорофора Мишень Область амплификации
FAM РНКВК Искусственно синтезированная
последовательность
R6G3 PHKSAR3-COV-2 Гены Мзр1 и RdRp региона ОРР1аЬ
3.1 Характеристика положительного контроля ПК SC2
Концентрация клонированного фрагмента кДНК 3AR3-CoV-2 в ПК ЗС2 составляет
5 1д ± 0,51д копий/мл. Концентрация определяется с помощью установленной
производителем методики выполнения измерений на основе метода лимитирующих
разведений [1,2].
4 НЕОБХОДИМОЕ ОБОРУДОВАНИЕ И МАТЕРИАЛЫ
Для работы с набором требуются следующие оборудование и материалы:
• ПЦР-бокс;
• центрифуга-вортекс (РУ № ФС № 2005/518);
• дозаторы переменного объёма, механические или электронные, с возможностью
дозирования от 5 до 200 мкл (РУ № ФСР 2009/05681);
• программируемый амплификатор с системой детекции флуоресцентного
сигнала в режиме «реального времени» (ДТпрайм (ООО «НПО ДНК-Технология»; РУ
№ ФСЗ 2011/10229), CFX96 (Bio-Rad Laboratories, Inc.; РУ № ФСЗ 2008/03399), Applied
2 В случае отсутствия доступа к Интернету обратитесь в службу технической поддержки по телефону
(495) 374-13-46 для запроса о предоставлении бумажной версии паспорта.
® Сигнал от флуорофора R6G регистрируется по каналу детекции сигнала от аналогичных
флуорофоров Hex и Joe.
Amplitech SARS-CoV-2 (D) Инструкция в. 14.11.22
--- стр. 7 ---
i
Biosystems QuantStudio 5 (Life Technologies Holdings Pte. Ltd.; РУ № P3H 2019/8446));
• штатив для пробирок объёмом 0,2 и 1,5 мл;
• холодильник с камерой, поддерживающей температуру от 2 "*0 до 8 °С;
• пробирки для ПЦР объёмом 0,2 мл с оптически прозрачной крышкой,
одноразовые, свободные от ДНКаз и РНКаз;
• пробирки объёмом 1,5 мл, одноразовые, свободные от ДНКаз и РНКаз, для
приготовления реакционной смеси;
• наконечники для дозаторов переменного объёма, с фильтром, объёмом до 10,
100 и 200 мкл, одноразовые, свободные от ДНКаз и РНКаз;
• ёмкость для сброса использованных материалов;
• перчатки медицинские, одноразовые, неопудренные.
5 ПРЕДУПРЕЖДЕНИЯ И МЕРЫ ПРЕДОСТОРОЖНОСТИ
5.1 Предупреждения
Класс потенциального риска применения набора (согласно Приказу Министерства
здравоохранения РФ № 4н от 06.06.2012) - 3.
Вирус SARS-CoV-2 отнесён ко М группе патогенности.
Набор не определяет наличие коронавируса SARS-CoV-2, если его концентрация
ниже заявленного предела обнаружения набора (500 копий/мл).
5.2 Меры предосторожности
Работа должна проводиться в лаборатории, использующей методы амплификации
нуклеиновых кислот для исследования материала, с соблюдением требований ГОСТ
Р 52905 «Лаборатории медицинские. Требования безопасности», МУ 1.3.2569-09
«Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации
нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV
групп патогенности», СанПиН 3.3686-21 «Санитарно-эпидемиологические требования
по профилактике инфекционных болезней».
При работе необходимо всегда выполнять следующие требования:
• Применять набор по назначению в соответствии с данной инструкцией.
Отклонение от прописанных процедур и порядка действий может привести к
получению недостоверных результатов исследования.
• К работе с набором допускается только персонал, обученный методам
молекулярной диагностики и прошедший специальную подготовку по безопасности
работы с патогенными биологическими агентами II группы патогенности.
• Рассматривать исследуемые образцы как инфекционно-опасные,
организовывать работу и хранение в соответствии с СанПиН 3.3686-21.
• Утилизировать реагенты (использованные, неиспользованные, пришедшие в
негодность в связи с истечением срока годности и/или несоблюдением
регламентированного режима хранения, транспортирования и применения) в
соответствии с требованиями СанПиН 2.1.3684-21 «Санитарно-эпидемиологические
Amplitech SARS-CoV-2 (D) Инструкция в.14.11.22
--- стр. 8 ---
требования к содержанию территорий городских и сельских поселений, к водным
объектам, питьевой воде и питьевому водоснабжению, атмосферному воздуху,
почвам, жилым помещениям, эксплуатации производственных, общественных
помещений, организации и проведению санитарно-противоэпидемических
(профилактических) мероприятий» к утилизации медицинских отходов класса Г.
• Не открывать пробирки с продуктами амплификации в процессе их сбора и
утилизации.
• Утилизировать внешнюю упаковку набора, инструкцию по применению и краткое
руководство в соответствии с требованиями СанПиН 2.1.3684-21 к утилизации
медицинских отходов класса А.
• Утилизировать биологический материал, а также расходные материалы и
инструменты, загрязнённые биологическим материалом, в соответствии с
требованиями СанПиН 2.1.3684-21 к утилизации медицинских отходов класса В.
• Не использовать набор, если нарушена внутренняя упаковка или внешний вид
реагента не соответствует описанию, указанному в таблице 1.
• Не использовать набор, если не соблюдались условия транспортирования и
хранения согласно инструкции.
• Не использовать набор по истечении срока годности.
• Использовать отдельный для каждого образца/реагента одноразовый
наконечник с фильтром.
• Использовать защитную одежду в соответствии с МУ 1.3.2569-09. Все операции
проводить только в одноразовых неопудренных перчатках для исключения контакта с
организмом человека.
• Не есть, не пить и не курить в процессе использования набора. Избегать контакта
реагентов с кожей, глазами и слизистой оболочкой. Не глотать.
Реагенты, входящие в состав набора, содержат натрия азид в концентрации не
более 0,05 %, поэтому не классифицируются как опасные для здоровья человека и
окружающей среды. При контакте немедленно промыть поражённое место большим
количеством воды и при плохом самочувствии обратиться за медицинской помощью.
При попадании внутрь рвоту не вызывать, прополоскать рот водой, обратиться к врачу
при плохом самочувствии.
Использование набора по назначению и соблюдение вышеперечисленных мер
предосторожности исключает негативное воздействие на организм человека.
6 ИССЛЕДУЕМЫЙ МАТЕРИАЛ
Набор предназначен для исследования только биологического материала,
указанного в разделе 1. Взятие, предварительную обработку, транспортирование и
хранение исследуемого биологического материала следует проводить в соответствии с:
• МР 3.1.0169-20 «Лабораторная диагностика СО\/Ю-19»:
• МУ 1.3.2569-09 «Организация работы лабораторий, использующих методы
амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим
АтрП1есЬ ЗАРЗ-СоУ-2 (Р) Инструкция В.14.11.22
--- стр. 9 ---
микроорганизмы 1-1\/ групп патогенности»;
• требованиями, перечисленными в таблицах 3 и 4.
Таблица 3
Требования к взятию и предварительной обработке исследуемого материала
Взятие мазков из ротоглотки или носоглотки
Взятие мазка провести с помощью сухого медицинского стерильного одноразового зонда
(например, ООО «ФармМедПолис РТ», Россия, РУ № РЗН 2021/13989) в пробирку с транспортной
средой для хранения и транспортирования данного вида биологического материала (например,
«Инактивирующая транспортная среда (ТС (О))» (ООО «Амплитек»), «Транспортная среда для
хранения и транспортировки респираторных мазков» (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии
Роспотребнадзора. Россия; РУ № ФСР 2009/05011)).___________________________________________
Взятие и предобработка мокроты
Взятие материала а количестве не менее 1 мл провести в стерильный одноразовый контейнер с
широким горлом (диаметром не менее 30 мм) и завинчивающейся крышкой.
Предобработка;
Провести разжижение мокроты, используя реагент для предобработки мокроты с целью
проведения экстракции нуклеиновых кислот (например, реагент «Муколизин» (ФБУН ЦНИИ
Эпидемиологии Роспотребнадзора, Россия; РУ № ФСР 2011/12082) или реагент, соответствующий
по составу требованиям п. 1.7 Приложения 2 МУ 1.3.2569-09).
Таблица 4
Требования к условиям транспортирования и хранения
исследуемого материала
Условия транспортирования Условия хранения
Мазки из носоглотки и ротоглотки
Согласно требованиям, указанным в инструкции к используемой транспортной среде.
Мокрота
При температуре от 2 ®С до 8 °С
При температуре от 2 °С до 8 ®С не более 2 суток;
При температуре минус 70 °С более 2 суток. Допускается
однократное замораживание материала.
Примечание - При невозможности обеспечить хранение
при минус 70 °С допустимо хранить при минус 20 '’С. * •
7 ПРОВЕДЕНИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
7.1 Исследование методом «прямой» ОТ-ПЦР (без экстракции РНК) мазков
из носоглотки и/или ротоглотки, взятых в транспортную среду «ТС (О)»
7.1.1 Прогреть пробирки с мазками, взятыми в «ТС (О)», при температуре 95 °С в
течение 3 мин, затем перемешать на вортексе.
7.1.2 Перемешать содержимое пробирок с реагентами, входящими в состав
набора, и осадить капли на вортексе.
7.1.3 Приготовить реакционную смесь для общего количества исследуемых и
контрольных образцов, добавив компоненты в отдельную пробирку в
объёмах из расчёта на один образец:
• 10 мкл ВК,
• 5 мкл Смеси-1 8С2 (О),
• 5 мкл Смесь-2 О.
Примечание - При расчёте объёмов реагентов необходимо учитывать запас каждого
АтрП1есЬ 5АК8-СоУ-2 (О) Инструкция в.14.11.22 8
--- стр. 10 ---
реагента не менее чем на один образец.
ВНИМАНИЕ! Компоненты реакционной смеси следует смешивать непосредственно
перед проведением ОТ-ПЦР.
7.1.4 Перемешать полученную смесь и осадить капли на вортексе.
7.1.5 Отобрать необходимое количество пробирок для проведения ОТ-ПЦР с
РНК исследуемых образцов и контролями (ОК и ПК). Промаркировать.
ВНИМАНИЕ! Каждая группа исследуемых образцов должна сопровождаться
постановкой контролей ОК и ПК 8С2 не менее чем в одном повторе.
7.1.6 Внести в пробирки по 20 мкл приготовленной реакционной смеси.
7.1.7 Внести в подготовленные пробирки с реакционной смесью по 5 мкл
исследуемых образцов биологического материала (мазков из
носоглотки/ротоглотки в «ТС (О)») и контролей (ОК, ПК 5С2).
7.1.8 Запрограммировать амплификатор для проведения ОТ-ПЦР и детекции
флуоресцентного сигнала согласно инструкции по его применению по
программе, указанной в таблице 5.
Примечание - При программировании амплификатора указать объём реакции; 25 мкл.
Таблица 5
Программа ОТ-ПЦР и детекции
Цикл Температура, Время Детекция по каналам для
флуорофоров
Количество
циклов
1 50 5 мин - 1
2 95 1 с
65 5с -
IU
3 95 1 с -
по
65 5с РАМ, ReG-*
7.1.9 Поместить пробирки с реакционной смесью и образцами в амплификатор и
запустить программу.
Примечание - Перед постановкой в амплификатор рекомендуется осадить капли со
стенок пробирок на вортексе.
7.2 Исследование образцов биологического материала, включая
экстракцию РНК
7.2.1 Перемешать содержимое пробирок с реагентами ВК, ОК и ПК 5С2 и осадить
капли на вортексе.
7.2.2 Провести экстракцию РНК из исследуемого материала и контролей с
использованием набора реагентов «РНК-100» (ООО «Амплитек»; РУ № РЗН
2021/14184) согласно инструкции по его применению, с учётом требований
к объёмам реагентов и образцов, указанных в таблице 6.
“ Сигнал от флуорофора R6G регистрируется по каналу детекции сигнала от аналогичных
флуорофоров Hex и Joe.
Amplitech SARS-CoV-2 (D) Инструкция в.14.11.22
--- стр. 13 ---
Таблица 9
Критерии оценки для контролей
Контроль Норма
ОК По каналу РАМ значение С1 определено не больше граничного®.
По каналу РбС значение С1 отсутствует.
ПК По каналу РАМ значение С1 определено не больше граничного.
По каналу РбО значение С1 определено не больше граничного.
9 ВОЗМОЖНЫЕ ОШИБКИ
Рекомендации по устранению возможных ошибок, получаемых для исследуемых
образцов и контролей в процессе исследования с помощью набора, указаны в
таблице 10.
Таблица 10
Рекомендации по устранению ошибок
Ошибка Возможная причина
возникновения
Для ПК значение С1 по
каналам РАМ и/или РбО
отсутствует или определено
больше граничного^._______
Некорректное
проведение экстракции
РНК и/или ОТ-ПЦР.
Рекомендации по устранению
Повторить исследование для всех
отрицательных образцовт
Для ОК по каналу РАМ
значение С1 отсутствует или
определено больше
граничного.______________
Некорректное
проведение экстракции
РНК и/или ОТ-ПЦР.
Повторить исследование для всех
образцов.
Для ОК по каналу РбО
определено значение С1.
Контаминация
реагентов или
исследуемых образцов
продуктами
амплификации._______
Предпринять меры по выявлению
и ликвидации источника
контаминации и повторить
исследование для всех образцов.1
Для исследуемого образца
по каналу РАМ значение С1
определено больше
граничного или отсутствует,
по каналу РбО значение С1
отсутствует.
Некорректное
проведение экстракции
РНК.
Наличие в образце
ингибиторов ОТ-ПЦР.
Повторить исследование данного
исследуемого образца. В случае
воспроизводимого результата
рекомендуется повторное взятие и
исследование биологического
материала.
____________________
10 КОНТРОЛЬ КАЧЕСТВА
10.1 Контрол и, используемые в процессе исследования
Результаты исследования контролей должны соответствовать критериям оценки,
указанным в разделе 8.
10.1.1 Отрицательный и положительный контроли
Каждая группа исследуемых образцов должна включать контрольные образцы:
• ОК для выявления контаминации в процессе проведения исследования;
• ПК 8С2 для контроля корректного прохождения исследования.
10.1.2 Внутренний контроль
Для контроля качества исследования и оценки влияния ингибиторов на результаты
® Граничные значения С1 указаны в кратком руководстве по применению набора.
АтрП1есЬ SARS-CoV-2 (О) Инструкция в.14.11.22 12
--- стр. 14 ---
J
1
амплификации используется экзогенный ВК, который добавляется в каждый
исследуемый образец и контроли. Отсутствие результатов амплификации для ВК и
одновременно для РНК вируса SARS-CoV-2 свидетельствует о присутствии
ингибиторов ОТ-ПЦР в образце или некорректном проведении экстракции РНК.
10.2 Мониторинг лаборатории на наличие контаминации
Для выявления возможной контаминации лаборатории продуктами амплификации,
исследуемыми и контрольными образцами рекомендуется раз в месяц исследовать
смывы с рабочих поверхностей лабораторной мебели, оборудования и поверхностей
помещений согласно процедуре, указанной в МУ 1.3.2569-09. При обнаружении
контаминации необходимо провести мероприятия по её устранению согласно
указаниям, описанным в МУ 1.3.2569-09.
10.3 Внутренний контроль качества лабораторных исследований
Рекомендуется проводить контроль качества выполнения исследований с
использованием панелей контрольных образцов, предназначенных для проведения
внутреннего и внешнего контролей качества лабораторных исследований по
обнаружению РНК вируса SARS-CoV-2, либо сравнительным исследованием с
использованием зарегистрированных в РФ наборов реагентов для качественного
определения РНК коронавируса SARS-CoV-2 в биологическом материале методом
ОТ-ПЦР.
11 ФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ НАБОРА®
11.1 Предел обнаружения
Предел обнаружения набора составляет 500 копий РНК SARS-CoV-2 в 1 мл
исследуемого образца (95 % ДИ: 288-813 копий/мл).
11.2 Аналитическая специфичность
По анализу результатов in sHico выбранные олигонуклеотиды позволяют
гарантировано дифференцировать SARS-CoV-2 от SARS-CoV-1, Human Coronavirus
229Е, ОС43, HKU1, NL63, MERS-coronavirus и других коронавирусов. При этом
подобранные праймеры и зонды на 100% совпадают с опубликованными
последовательностями SARS-CoV-2, представленными в базах GISAID и NCBI по
состоянию на 30 июля 2021 г.
Аналитическая специфичность набора оценивалась при тестировании
микроорганизмов, указанных в таблице 11, и геномной ДНК человека. НК
микроорганизмов исследовались в концентрациях, указанных в таблице 11, геномная
ДНК человека - в концентрации 1 мкг/мл. По итогам тестирования
ложноположительных результатов выявлено не было.
^ Заявленные аналитические характеристики набора, кроме аналитической специфичности, проверены
с использованием стандартного образца предприятия, содержащего вектор со специфической
последовательностью РНК 8АРЗ-Со\/-2.
Amplitech SARS-CoV-2 (D) Инструкция в.14.11.22 13
--- стр. 15 ---
Таблица 11
Микроорганизмы, используемые для оценки аналитической специфичности
Наименование Концентрация Наименование Концентрация
Human Metapneumovirus
ÍHM-1) 3,33-1(>ЧСЮ5о/мл Respiratory syncytial virus
(hRSV-1) 3,33-10“ ТСЮбо/мл
Parainfluenza virus типа 1
(Сендай) 3,33-lg Юбо/мл Haemophilus influenza
(ATCC® 49247™) 3,33-IOS КОЕ/мл
Influenza virus A
(A/Anhui/1/2013(H7N9)) 3,33-10“ ТСЮбо/мл Streptococcus pneumoniae
(ATCC® 49619™) 3,33-105 КОЕ/мл
Influenza virus В
(В/Москва/46/2019) 1:32 ГАЕ Legionella pneumophila
(ATCC 33152) 1,67-109 КОЕ/мл
Adenovirus типа 5 3,33-10“ ТСЮбо/мл SARS-CoV-2 (ГК2020/1) ‘ 3,33-10® копий/мл
Human Rhinovirus A
(Рино/1 а/ Ленинград/78) 3,33-10“ БОЕ/мл SARS-CoV-2 (вариант
«Омикрон», ГВК1343) 6,0-108 гэ/мл
MERS-CoV 3,33-10“ БОЕ/мл SARS-CoV-2 (вариант
«Дельта». ГВК1338) 1,6-109 ГЭ/мл
11.2.1 Потенциально интерферирующие вещества
Потенциально интерферирующие вещества (ингибиторы ОТ-ПЦР) и их
максимальные концентрации в образце, для которых оценивалось их ингибирующее
влияние на ОТ-ПЦР, перечислены в таблице 12.
Таблица 12
Потенциально интерферирующие вещества
Исследуемый
материал Интерферент Активный
компонент
Тип интерфе-
рента
Концентрация
вещества в
образце
Обоснование
исследованной
концентрации
Мазки из
носоглотки
и/или
ротоглотки,
мокрота
Раствор
хлоргексидина Хлоргексидин
Антисептиче
ское средство
для местного
применения
0,25 %
10% от
рекомендован
ной дозы
Раствор
Люголя с
глицерином
Йод 0,1 %
Стоматофит®
Экстракт жидкий
из смеси
растительного
сырья
1,5%
Мирам истин®
Бензилдиметил [3-
(миристоиламино)
пропил] аммоний
хлорид
моногидрат
0,001 %
Объём в
Цельная кровь
Эндогенная
5 % V /V образце в
Муцин Очищенный белок
субстанция
5 % v/v
условиях
«наихудшего
случая»
Наличие возможного ингибирующего эффекта оценивалось двумя способами:
• путём проведения процедуры экстракции РНК 5АР5-Со\/-2 с использованием
набора реагентов «РНК-100» (ООО «Амплитек») из модельных образцов
биологического материала, в которые добавлялись потенциальные интерференты в
концентрациях согласно таблице 12 и стандартный образец предприятия,
содержащий РНК вируса 5АР5-Со\/-2 в концентрации 500 копий/мл. Далее с
экстрагированными образцами проводили ОТ-ПЦР с детекцией в режиме «реального
времени» с использованием набора реагентов «АтрН1ес11 8АР8-Со\/-2 (О)».
Amplitech SARS-CoV-2 (D) Инструкция в.14.11.22 14
--- стр. 16 ---
• методом «прямой» ОТ-ПЦР с модельными образцами биологического материла
(мазки из носоглотки и/или ротоглотки) в транспортной среде «ТС (О)» (ООО
«Амплитек»), в которые добавлялись потенциальные интерференты в концентрациях
согласно таблице 12 и стандартный образец предприятия, содержащий РНК вируса
8АК8-Со\/-2 в концентрации 500 копий/мл.
В результате испытаний подтверждено, что влияние исследованных потенциально
интерферирующих веществ на ОТ-ПЦР, проводимую с использованием набора
«АтрП1есИ 8АР8-Со\/-2 (О)», отсутствует.
11.3 Прецизионность измерений
Коэффициент вариации повторяемости СУп пороговых циклов (С1),
характеризующий внутрисерийную повторяемость измерений с использованием
набора, не превышает 5 %.
Коэффициент вариации воспроизводимости СУв пороговых циклов (С1),
характеризующий межсерийную воспроизводимость измерений с использованием
набора, не превышает 10 %.
11.4 Диагностические характеристики
Значения диагностической чувствительности (ДЧ) и диагностической
специфичности (ДС) набора с доверительной вероятностью 95 % указаны в
таблице 13.
Таблица 13
Диагностические характеристики
Исследуемый материал Количество образцов дч,% дс.%положит. отрицат.
Мазки из носоглотки 160 205 97,7-100 98,2-100
Мазки из ротоглотки 160 205 97,7-100 98,2-100
Мокрота 100 100 96,4-100 96,4-100
12 УСЛОВИЯ ХРАНЕНИЯ. ТРАНСПОРТИРОВАНИЯ И ЭКСПЛУАТАЦИИ
НАБОРА
12.1 Срок годности
Срок годности набора составляет 13 месяцев от даты изготовления.
После вскрытия реагенты использовать до истечения срока годности набора.
12.2 Хранение
Набор хранить при температуре от 2 °С до 8 ®С в защищённом от солнечного света
месте.
Реагенты после вскрытия хранить в тех же условиях, что и реагенты до вскрытия.
12.3 Транспортирование
Набор транспортировать при температуре от 2 °С до 8 °С всеми видами крытых
транспортных средств в термоконтейнерах с хладоэлементами или в
авторефрижераторах.
АтрН1есЬ 8АР8-СоУ-2 (О) Инструкция в.14.11.22 15
--- стр. 17 ---
Реагенты, входящие в состав набора, готовы к использованию.
Повторное применение использованных для исследования реагентов не
допускается.
Исследование образцов с использованием набора должно проводиться при
температуре от 18 до 25 °С и относительной влажности воздуха от 25 % до 75 %.
13 ПЕРЕЧЕНЬ СОКРАЩЕНИЙ
В настоящей инструкции применены следующие сокращения:
Ct - cycle threshold (пороговый цикл)
ВК - внутренний контроль
ДИ - доверительный интервал
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ДНКаза - дезоксирибонуклеаза
ОК - отрицательный контроль
ОТ - обратная транскрипция
ПК - положительный контроль
ПЦР - полимеразная цепная реакция
РНК - рибонуклеиновая кислота
РНКаза - рибонуклеаза
14 БИБЛИОГРАФИЯ
1. Taswell С. Limiting dilution assays for the determination of immunocompetent cell
frequencies // J. Immunology, - 1981. - Vol. 126. - P. 1614-1619
2. Allen G. Rodrigo, Paul C. Goracke, Kiarash Rowhanian, James I. Mullins. Quantitation
of target molecules from polymerase chain reaction-based limiting dilution assays // AIDS
research and human retroviruses. - 1997. - Vol. 13 (9). - P. 737-742
15 ПЕРЕЧЕНЬ ПРИМЕНЯЕМЫХ НАЦИОНАЛЬНЫХ СТАНДАРТОВ
ГОСТ Р 51088-2013 Медицинские изделия для диагностики ин витро. Реагенты,
наборы реагентов, тест-системы, контрольные материалы, питательные среды.
Требования к изделиям и поддерживающей документации
ГОСТ Р 51352-2013 Медицинские изделия для диагностики ин витро. Методы
испытаний
ГОСТ Р ИСО 18113-2-2015 Медицинские изделия для диагностики in vitro.
Информация, предоставляемая изготовителем (маркировка). Часть 2. Реагенты для
диагностики in vitro для профессионального применения
ГОСТ Р ИСО 23640-2015 Изделия медицинские для диагностики in vitro. Оценка
стабильности реагентов для диагностики in vitro
ГОСТ Р ИСО 15223-1-2020 Изделия медицинские. Символы, применяемые при
маркировании на медицинских изделиях, этикетках и в сопроводительной
документации. Часть 1. Основные требования
12.4 Эксплуатация
Amplitech SARS-CoV-2 (D) Инструкция в.14.11.22 16
--- стр. 18 ---
16 ГАРАНТИИ ПРОИЗВОДИТЕЛЯ
Производитель гарантирует соответствие характеристик набора требованиям,
указанным в технической и эксплуатационной документации, в течение указанного
срока годности при соблюдении условий его транспортирования, хранения и
применения.
Рекламации на качество набора направлять в адрес производителя: ООО
«Амплитек», 109235, Москва, ул. 1-я Курьяновская, д. 34, стр. 8, этаж 1 пом. II ком. 42,
тел. (495) 374-13-46, e-mail: support@amplitech.ru .
Сообщения о неблагоприятных событиях (инцидентах), возникших при работе с
набором и не указанных в данной инструкции, следует направлять производителю по
указанному выше адресу и в уполномоченный регуляторный орган согласно
действующему законодательству.
17 ТЕХНИЧЕСКАЯ ПОДДЕРЖКА
Консультацию по вопросам по работе с набором и его качеству можно получить по
контактам, указанным на официальном сайте производителя: www.amplitech.ru .
18 СИМВОЛЫ, ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ В ДОКУМЕНТАЦИИ ПРОИЗВОДИТЕЛЯ
H i Изготовитель
IVD
□ а
Дата изготовления
Медицинское изделие для
диагностики in vitro
Обратитесь к инструкции по
применению
Содержимого достаточно для
проведения п тестов
REF
LOT
Ж
Номер по каталогу
Код серии
Использовать до
Предел температуры
Не допускать воздействия
солнечного света
У
Общество с ограниченной ответственностью «Амплитек»
(ООО «Амплитек»),
Россия, 109235, Москва,
ул. 1-я Курьяновская, д. 34, стр. 8, этаж 1 пом. II ком. 42
тел, (495) 374-13-46, www.amplitech.ru ,
e-mail; support@amplitech.ru
Amplitech SARS-CoV-2 (D) Инструкция в. 14.11.22 17
--- стр. 19 ---
Лист регистрации изменений
Изм.
Номера страниц Всего
страниц в
документе
Номер документа Подпись Датаизменён
ных
заменён
ных новых аннулиро
ванных
/ - — —
Атр1«есЬ SARS-CoV-2 (О) Инструкция 18